本发明公开了一种复杂风场作用下的输电杆塔倾斜实时监测方法及系统，涉及输电杆塔监测技术领域，其技术方案要点是：建立各个轴向振动分量与对应轴向风速分量之间的拟合函数；从实时振动数据中筛选出多个风速处于平稳状态的振动区段；筛选出两个差异优先值最高的振动区段；根据拟合函数以及第一区段与第二区段的平稳风速计算理论振动偏差；确定相应轴向的实际振动偏差；若存在实际振动偏差不符合理论振动偏差的判断逻辑的情况，则输出表征目标杆塔处于倾斜变形的预警信号。当输电杆塔在两个不同风速作用后均处于自身结构变形或损坏所导致的倾斜状态，本发明也可以准确监测，能够在输电杆塔处于风致振动过程中进行实时预警。