本申请提供的一种风电机组仿真模型和控制保护程序管控系统，该系统包括支撑单元、管理单元和应用单元；支撑单元中的安全管控模块可以对风电机组仿真时所需的仿真模型、控制保护程序及对应的校验码进行加密和用户权限设置；管理单元中的仿真模型版本管理模块可以对各个版本的仿真模型进行管理，源代码和运行库版本管理模块可以对各个版本的控制保护程序的源代码和可执行代码进行管理，整理版本管理模块可以对其他两个模块在管理过程中的关键信息进行记录并整合后，形成记录清单；应用单元中的源数据提供模块可以为用户提供仿真模型以及控制保护程序的源代码和可执行代码，校验模块可以对待运行的控制保护程序和仿真模型进行校验。