本发明公开了一种穿刺组织的消化处理方案，包括组织的分离和悬浮、组织的酶消化、消化液的过滤和初步离心、去除红细胞、再次离心、清洗细胞团、丢弃上清和重复清洗和鉴定，本发明通过各种消化酶的组合方案，处理成可以达到单细胞文库上机标准的单细胞悬液，高效的单细胞分离、高纯度的细胞悬液、保留细胞活性以及低样本消耗，有效从有限的穿刺样品中分离出足够数量的单个细胞或小块细胞团，满足下游应用需求，温和的分离条件和多重清洗，可以最大限度保留细胞的活性，并且通过分离设备，有效分离消化液中的小块细胞团，同时最大限度保留细胞的活性，并去除多余的基质，获得高纯度准备用于下游应用的细胞悬液和油包细胞。