本发明公开了一种用于确定电网短路故障下双馈风机负序电流的方法及系统，属于电气设备及电气工程技术领域。本发明，包括：建立电网DFIG转子侧未投入Crowbar保护回路情况下的第一DFIG等效负序阻抗模型，或电网DFIG转子侧投入Crowbar保护回路情况下的第二DFIG等效负序阻抗模型；基于所述第一DFIG等效负序阻抗模型，或所述第二DFIG等效负序阻抗模型，建立电网负序网的节点电压方程和电网的故障边界条件方程；联立所述节点电压方程和所述故障边界条件方程，进行求解，以得到电网各节点的负序电压，以及电网各支路的负序电流，基于所述负序电压及负序电流，确定电网短路故障下双馈风机的负序电流。本发明能够提高DFIG短路电流分析和控制技术水平。