本发明提供一种非侵入式应用程序运行状态监测方法、装置及设备，所述方法包括：获取待监测应用程序；待监测应用程序为协同制造系统中的至少一种类型应用程序；对待监测应用程序进行分类，得到添加了类别标签的至少一个待监测应用程序；生成目标类别的待监测应用程序的运行状态监测配置文件，运行状态监测配置文件包括：目标类别的待监测应用程序的至少一个监测点和与监测点对应的监测规则；根据监测配置文件，对目标类别的待监测应用程序进行运行状态监控，得到目标类别的待监测应用程序运行状态，输出并展示目标类别的待监测应用程序运行状态。本发明的方案无需对应用程序进行二次编码，可以监测和分析整个协同制造系统的运行状态和性能。