本发明公开了一种模拟海平面变化下岛礁形貌演变的分析方法。可应用于海洋工程技术领域。本发明通过获取岛屿物理参数以及岛屿近海参数，再根据岛屿二维剖面图构建所述岛屿的二维冲刷模型，并对二维冲刷模型进行网格大小划分，设置模拟初始条件和模拟边界条件，同时根据岛屿沉积物参数确定沉积物运输方式，以及根据岛屿近海参数设置岛屿模拟运行时间，然后根据网格划分后的二维冲刷模型、模拟初始条件、模拟边界条件、沉积物运输方式和岛屿模拟运行时间进行岛屿形貌变化模拟，从而大大减少模拟运行时间，进而有利于分析岛屿在海平面上升作用下的演变规律，为岛屿适应未来海平面上升制定合理的保护措施提供帮助，提高岛屿安全性。