本发明公开了一种用于超特长隧道多工作面施工的通风系统及通风方法，通风系统包括设置在隧道左洞进口处的第一风机、右洞进口处的第四风机、服务隧道进口处的第二风机和第三风机，每只风机的风口处分别接有风管，风管沿主洞洞体、服务隧道的洞体或横通道延伸至隧道的各个施工工作面。本发明通过在服务隧道向两侧主洞增设横通道，增加左右主洞工作面，实现长隧短打，缩短工期，隧道左右主洞通过横通道与服务隧道相互连通，送风时可实现超特长隧道多工作面同时供风。