本发明公开一种高空大气紊流主动模拟风洞试验方法，属于低速风洞试验领域，本方法通过试验段入口布置主动气流干扰装置在试验段下游产生不同强度速度扰流并借助流场校测系统进行速度测量，利用大气紊流数学建模方法获取大气紊流时域速度模型，通过对扰动速度场校测计算扰动速度传播衰减系数和平板摆动增益控制系数，最终得到目标大气紊流对应的平板运动摆角数据，该方法弥补了非均匀流场模拟试验中对大气紊流这类随机变化非定常流场模拟能力不足的问题。本发明的试验方法可以在风洞环境模拟高空大气紊流场，具有大气紊流强度模拟能力强，紊流积分尺度调节范围广，模拟重复性好的优点。