本发明公开了一种基于深度学习的新能源发电功率预测方法，包括将历史数据中除去发电功率的数据根据预设的时间间隔进行划分生成矩阵Mc，将历史发电功率根据其大小排列后同样进行划分生成矩阵后进行扩充得到矩阵Mx；从矩阵Mx中划出矩阵区域My作为其标签数据；搭建包括两个下采样模块和一个上采样模块的深度学习网络；将样本数据Mc、Mx和标签数据My传入深度学习网络中进行训练，得到可以进行新能源发电功率预测的深度学习网络。本发明能够有效提高新能源短期发电功率的预测精度。