本发明属于食品营养与健康和水产品高值化利用领域，具体涉及一种鲟鱼卵巢抗氧化肽的制备方法。本发明以鲟鱼卵巢为原料，从酶解法水解鲟鱼卵巢获得抗氧化肽角度切入，采用传统分离纯化与生物信息学联用的技术，筛选出两条具有抗氧化活性的鲟鱼卵巢蛋白肽，其氨基酸序列为：Phe‑Asp‑Trp‑Asp‑Arg‑Leu；Phe‑Glu‑Gly‑Pro‑Pro‑Phe‑Lys‑Phe；本发明的制备工艺简单、成本低、条件温和，有效地保持了鲟鱼肽的抗氧化活性，既可以解决鲟鱼的高值化利用问题，又能作为一种功能性因子应用于功能性产品当中，具有开发新的保健食品的潜力，有助于实现鲟鱼高值化利用。