本发明提供一种天然抗冻肽及其制备方法和应用，本发明所提供的抗冻肽，是将鱼子用无花果蛋白酶和碱性蛋白酶进行酶解，酶解产物收集上清液，上清液利用10kDa的膜进行过滤，过滤液利用1000Da的膜过滤，收集截留液；得截留液经喷雾干燥制成抗冻肽。本发明制备的高热滞活性的抗菌肽加入到金黄色葡萄球菌菌液中，通过细菌低温保护实验测定菌落计数和菌液OD600，研究发现空白对照和阴性对照与抗菌肽处理组相比，细菌存活率显著降低，表明高THA活性抗菌肽处理组对金黄色葡萄球菌具有良好的低温保护效果。