本发明提供一种用于诊断脑血栓的核磁共振造影剂及其应用，所述核磁共振造影剂由4臂‑氨基‑聚乙二醇2‑4份、钆喷酸葡胺15‑30份、卵磷脂80‑120份、胆固醇10‑20份、葡聚糖5‑10份、胸腺肽α18‑16份、KRDS肽3‑6份、注射用水制备得到。本发明通过对核磁共振造影剂的配方进行改进，有效改善了核磁共振造影剂的存储稳定性，有利于临床使用。此外，本发明还同时还有效提高了核磁共振造影剂的血脑屏障的通过率，实现了核磁共振造影剂在脑血栓部位的富集，显著增强了脑血栓的核磁共振显像效果，可以明显降低核磁共振造影剂所需剂量。