本发明提供了基于搜索识别网络的双壳贝类性腺区域分割方法，包括：获取双壳贝类数据集；构建多效特征融合的搜索识别模型；所述搜索识别模型包括：搜索模型和识别模型；将所述数据集中的图像输入所述搜索模型进行性腺区域目标定位，获取含有目标对象的图像；将所述含有目标对象的图像输入所述识别模型进行识别分割，获取完整的性腺分割图像，完成双壳贝类性腺区域分割。与传统的破坏外壳抽取内部组织来观测性腺发育情况的方法相比，本发明在无损伤核磁检测基础上针对灰度图像进行一定的分割，从而为以后利用当下现有技术融合进行水产养殖的应用奠定了基础。