本发明涉及一种辅助血细胞分析仪判定异常血小板聚集的方法和系统。包括如下步骤：S1、取血液样本放置入血细胞分析仪进行血小板计数；S2、血细胞分析仪异常报警，读取仪器血小板计数的每升值b；S3、取报警样本制作血涂片并进行镜检，读取镜检血小板聚集数值a和显微镜油镜视野下的视野数n；S4、根据如下公式计算血小板聚集指数c：S5、设定c的阈值，当c大于阈值时，判定样本为阳性；当c值≤阈值时，判定样本为阴性。本发明与现有技术相比，其显著优点是：通过计算血小板聚集指数c,可以显著降低血细胞分析仪异常血小板聚集报警的出错率，节省了检验试剂耗材，提高了检验效率，是对当前血小板计数方法的有益补充。