本发明的一种公共楼宇电能替代潜力评估方法及系统，包括将公共楼宇的非电等效负荷时间序列以及温度序列进行经验模态分解；将分解得到的固有模态函数在其之间的最大瞬时周期进行滑动拓展；计算任意时刻不通过阶数的固有模态函数的模态时序相关矩阵；构建加权相关性指标用于确定两个固有模态函数之间的动态相关性，确定受电价因素影响较大的非电负荷的比重，得到楼宇电能替代潜力。本发明计及电能价格的非电等效负荷概念，能够将时变的电能价格影响因素纳入用能负荷特性的分析过程中，提高了用能特性分析的精度；基于模态时序相关矩阵进行电能替代潜力的评估方法，精准刻画了不同时间尺度下用户用能需求的变化潜力，提高电能替代潜力评估的精度。