一种非水介质的活性染料棉织物染色方法，以两种改性壳聚糖化合物溶解于DMSO/DMC中作为有机溶液介质；将活性染料溶解在水性聚氨酯乳液中得染液；将染液在高速搅拌条件下缓慢加入到有机溶液介质中，得到非水介质的活性染料液；之后进行染色吸附，以有机碱进行固色。本发明中活性染料溶解在少量的水性聚氨酯乳液中，与聚氨酯中氨基等形成氢键，提高结合牢度；之后加入到含改性壳聚糖化合物的有机溶液介质中，可以对棉织物进行有效染色，上染率高；染色工艺中条件温和，操作简单；在有机碱的存在下提高固色率，避免染色后的棉织物出现掉色现象，以有机溶液为介质，减少水的用量，有机溶液可回收，减少水污染。