本发明公开了食品制备领域的一种利用酶催化蔗糖制备特殊膳食用运动营养食品的方法其以蔗糖为原料经过果糖基转移酶、多聚果糖蔗糖酶、轻度催化蔗糖得到5‑10％单糖、60‑70％双糖、10‑15％低聚果糖、10‑15％多聚果糖然后过滤得到清净液，复配营养素多种矿物质和多种维生素，杀菌、灌装得到液态特殊膳食用运动营养食品，或者经过浓缩、真空干燥得到固体粉末特殊膳食用运动营养食品。通过酶催化蔗糖转化得到比例合适的单糖、二糖、低聚果糖、多聚果糖的产品符合特殊膳食用运动营养食品补充能量类，并快速且逐级提供能量给人体。