本发明提供了一种基于空管历史飞行数据预测航班飞行高度的方法，包括：建立关注区域内航路段数据库；基于各航路段，建立历史航班影响因素数据库；基于各航路段，建立历史航班数据库；针对新拟制航班飞行计划，根据历史飞行数据，在战略和预战术流量管理阶段，预测其在各航路段上的飞行高度。本发明方法充分利用现有民航空管系统信息资源，基于航空公司航班运营策略的连贯性和空管运行的稳定性原则，预测航路段在相似运行环境下相关航班的飞行高度，预测结果准确度高，进而提高了战略和预战术阶段飞行流量预测的精准度。以精准的飞行流量预测为基础，才能提前制定精准的流量管理措施，确保空中交通安全、有序、高效。