本发明公开了一种固定化复合己酸菌及其制备方法和应用。制备方法如下：(1)纯种己酸菌液的制备；(2)酵母菌液的制备；(3)复合己酸菌液的制备：将纯种己酸菌液与酵母菌液进行混合；(4)吸附载体的制备：取杏鲍菇，切碎，洗净，灭菌即得；(5)复合己酸菌的吸附：将处理好的吸附载体浸入制备好的复合己酸菌液，进行充分吸附；(6)包埋液的制备：将琼脂溶于水中，加热融化，灭菌即得；(7)将已吸附己酸菌的杏鲍菇载体均匀浸入包埋液中，凝固后得到固定化复合己酸菌。本发明提供的复合固定化己酸菌产己酸量高，产酸效果稳定。所述固定化己酸菌主要应用于白酒酿造领域，能够显著提高酒中己酸及己酸乙酯含量，显著提高白酒品质。