本发明涉及一种碳酸盐岩储层的逆序酸压方法，包括：S1：基于目标储层的工程地质特征，计算在注入一定量的前置液条件下形成的水力裂缝几何尺寸和水力裂缝中的平均温度；S2：计算水力裂缝中形成稳定黏性指进所需的高黏酸液与低黏酸液的黏度比和注酸量；S3：开展室内酸液流变性实验，基于S2确定的高黏酸液与低黏酸液的黏度比，确定满足逆序注酸黏度比的酸液体系；S4：由S3确定的酸液体系和S2确定的注酸量，开展逆序酸压施工，即多级交替注入高黏酸液与低黏酸液。本发明原理可靠，操作简便，通过利用酸液体系的黏性指进现象增加酸液在水力裂缝中的非均匀刻蚀，能够有效提高裂缝导流能力和酸液有效作用距离，具有广阔的市场应用前景。