规模风电并网加剧了不同区域间惯量分布不均的问题，给多区域系统的频率安全防御带来挑战。本发明提出一种兼顾风电出力不确定性与多区域频率动态安全的两阶段风险调度模型。第一阶段基于条件风险价值理论协同优化多区域系统的运行成本与运行风险，并求得风电可接纳安全边界。第二阶段在恶劣风电场景下进行多区域频率动态安全校核。将备用容量解耦为非事故备用与事故备用，分别嵌套于两阶段模型中，实现求解思路的清晰化。最后通过列与约束生成算法求解此两阶段优化问题。算例仿真验证表明，本发明所提模型和方法能有效提升多区域系统的频率响应能力，保证安全经济运行。