本发明公开了一种基于GMDH神经网络的双层复合衬垫击穿时间计算方法属于涉及环境岩土和深度学习领域。在计算阶段，通过使用解析解公式或数值模拟的方法，对单层复合衬垫常见工况的击穿时间进行计算，并在此基础上使用GMDH神经网络对击穿时间及其影响因素的关系进行黑盒模型运算，得到击穿时间计算的简化公式，并使用另一部分数据对结果进行检验，得到精简准确的计算公式。后续根据已有简化公式，将双层复合衬垫进行分层考虑，并得到双层复合衬垫总击穿时间与分层击穿时间的关系，其结果不但客观准确，且计算方便。