本发明属于微生物学发酵领域，具体涉及一种利用脂肪酸代谢调控提高抗菌脂肽bacillomycin D产量的方法：以一株能够合成bacillomycin D的芽孢杆菌为出发菌株，在发酵起始时分别添加0.25~5 mmol/L的丙酸钠、丙酸、丁酸等3种脂肪酸或脂肪酸盐，增加培养基中的游离脂肪酸，进而调控脂肪酸代谢途径，增加活性bacillomycin D发酵产量。本发明在基础培养基中添加丙酸钠、丙酸以及丁酸，均可使bacillomycin D产量显著提高，分别可达到对照组的1.44倍、1.4倍和1.1倍；丙酸钠的添加促进bacillomycin D合成基因的表达，从基因水平上佐证了其对bacillomycin D合成的促进作用。同时，丙酸钠可以引发部分信号因子表达上调，这些上调均可促进bacillomycin D的合成。此外，丙酸钠还可促进部分脂肪酸代谢相关酶的表达上调，进而促进脂肪酸的代谢。