本发明公开了一种水质监测系统和使用方法，具体涉及水质监测技术领域，包括安装匣，所述安装匣上部开设有收缩槽，所述安装匣下部开设有传动槽。本发明通过在安装匣前壁安装伸缩扩展机构，使得升降匣和两个折叠匣可打开呈一水平的水质监测平台，露出储存在升降匣中的水质监测仪器，提供足够的监测操作空间，使监测人员可对水样进行现场检测分析，水质监测时效性高，效率高，现场检测对水质监测仪器的伤害小，保证了监测头的灵敏度，提高了水质的监测精度，实用性强，通过在传动槽内安装深度定位机构，可对各个水域不同深度的水样进行采集，监测各个深度水层区域的水体状态，满足各个深度的水质监测需求，适用性强，准确性高。