本发明公开了一种基于纵横交叉算法的直流微电网稳定性趋优控制方法，包括以下步骤：S1：求出多源多负荷直流微电网系统的小信号模型；S2：通过特征根分析方法求出系统的主导模态，通过参与因子法解耦状态变量对主导模态的影响程度；S3：将纵横交叉算法应用于直流微电网稳定性分析中，获取趋优参数达到系统的最佳稳定性，使直流微电网拥有更大的稳定裕度，从而实现稳定性趋优控制；本发明利用纵横交叉算法能够实现全局并行搜索且收敛速度快的优点，可快速获得参数的趋优解，有效地规避参数局部解对稳定性分析的影响，使直流微电网拥有尽可能大的稳定裕度，实现稳定性趋优控制。