本发明涉及一种基于红外相机与二轴转台的激光自动对准系统，主要应用于激光测量中的激光自动对准角锥中心的过程。所述的基于红外相机与二轴转台的激光对准系统包括激光器及转台端和角锥端两大部分。其中转台端利用二轴转台实现对激光准直器方向的实时控制并与角锥端上位机间建立无线通信；角锥端用于对激光光斑进行图像处理与定位。借助于转台端对准直器方向的控制、角锥端对光斑的位置定位以及两端之间的通信，根据角锥端得到的位置信息实时控制转台的方向，以达到将转台端所发射激光引导至角锥棱镜中心的目的。该系统能解决目前实验室激光测量过程中手动对光过程较为繁琐的问题，提升激光测量过程中的自动化程度。