本发明公开了一种基于改进SCA和QRGRU的径流区间预测方法及系统，包括：(1)对预先获取的原始数据进行预处理，并将处理后的各项数据按时间转换成为矩阵型序列；(2)利用PSR方法与RF模型对时间训练进行特征选择，挑选出RF中重要性高的时间序列与PSR重构出的多维序列组成数据集；(3)采用混沌Tent映射和非线性因子对SCA算法进行改进，并利用改进后的SCA算法对GRU模型的隐藏层单元数目与学习率进行寻优；(4)构建QRGRU模型，初始化模型的参数；(5)建立QRGRU的径流区间预测模型，对径流时间序列进行预测，输出误差与区间预测的结果。本发明用QRGRU模型的对径流进行区间预测，预测结果能够描述确定性预测难以反映的不确定性问题，且其结果具有更高的可信度。