本发明公开了微流控装置和微流控工作系统。该微流控装置主要包括：电路底板、微流道基板、检测芯片、盖板、定位销、旋转阀、阀扳手以及注射器。本发明采用旋转方式切换定位销的选择，然后利用阀槽结构在实现旋转运动的同时控制定位销的上下运动以实现流体通道的选通，这样可以在单电机驱动下实现多路切换；引入超高频声波器件可以实现局部样本的强烈混合，而且可防止粒子溶液在流道内堵塞，使生化反应充分且装置功能完全，能够集样本驱动、混合、切换控制功能为一体。本发明具有密封性好、旋转顺滑、重复利用率高、易于加工、价格低廉、操作简单、易于与下游生化分析芯片结合等优点，对于促进基因分析等技术的推广应用具有促进意义。