本发明公开了一种BOTDA系统、控制方法及存储介质，BOTDA系统包括：耦合单元，用于接收连续光信号，并将连续光信号耦合为连续光测试信号及连续光工作信号；光开关单元，与耦合单元连接；FBG处理模块，与光开关单元连接，至少用于对接收的连续光测试信号滤波处理，并读取滤波后的连续光测试信号的测试光功率值；控制模块，与FBG处理模块连接，被配置为：获取连续光测试信号的初始光功率值和测试光功率值；将初始光功率值和测试光功率值的差值的绝对值与预设光功率阈值进行比较，并在差值的绝对值大于预设光功率阈值时，控制FBG处理模块调节温度，直至差值的绝对值小于或等于预设光功率阈值，提高经过外接传感光纤后的连续光工作信号的滤波效果。