本发明公开了一种零担货物多点装载方法及系统，该方法包括以下步骤：S1、采集零担货物信息，零担货物信息包括货物基本信息和车辆运输信息；S2、根据采集的零担货物信息，利用分类算法对货物按照相同目的地的范围、相同运输日期进行分类；S3、根据货物分类结果和车辆的装载量分配车辆，确定每辆车需要装载的目的地范围及运输日期；S4、根据车辆装载运输的装载率和每公里耗油量，规划总油耗量最少的路径为每辆车的最优多点装载路径；S5、按照每辆车需要装载的目的地范围及运输日期、规划的最优多点装载路径引导车辆进行货物装载和运输。本发明能够使得到达多个地点的耗油量最低，降低零担货物多点装载的成本，提高物流公司的利润。