本发明涉及一种基于焦化装置除焦周期的气柜压缩机操作方法及系统，方法包括：获取当前与预先指定的用于优化的气柜连接的压缩机的运行状态信息、压缩机后路返回气柜的情况信息、高压瓦斯系统内额外补充燃料气的状态信息；基于当前与所述预先指定的用于优化的气柜连接的压缩机的运行状态信息、压缩机后路返回气柜的情况信息、高压瓦斯系统内额外补充燃料气的状态信息，判断是否符合压缩机不能进行操作优化的条件，若符合，则输出当前运行状态与负荷；若不符合，则采用相应的策略降低压缩机运行负荷或降低补充燃料气或关闭与所述预先指定的用于优化的气柜连接的压缩机中任一台压缩机。