本发明公开了一种穿梭车多重安全防护系统，具体是由巷道外围防护单元、穿梭车主动防护单元及穿梭车碰撞防护装单元三重措施进行可靠的安全防护，巷道外围防护单元包括门开关及测距光栅装置；其中，门开关串联至穿梭车的急停电路中，测距光栅装置与穿梭车控制系统电信号连接。穿梭车主动防护单元包括安装在穿梭车且与穿梭车控制系统电信号连接的激光扫描器。穿梭车碰撞防护单元包括在穿梭车的凸出部位上设置的防撞条，并在防撞条与穿梭车之间布设若干个与穿梭车的急停电路串联的碰撞传感器。本发明从外到内构造的多重屏障，能够有效检测非法侵入情况，也能用来防范轨道内发生碰撞，还可以在碰障后大幅降低伤害，因而大大提高了穿梭车运行的安全性。