本申请提出了一种基于CFD模拟的海底管道的振动频率监测方法和系统，该方法包括：在CFD模拟软件中建立模拟任务；设置模拟任务所需的物理模型和物理模型的物理参数；建立海底管道的二维冲刷模型，对二维冲刷模型的计算域进行网格划分，并设置计算域的初始条件和边界条件；在海底管道的模型上设置监测点，采集监测点所受的流体力，以获取海底管道的流体力时程变化曲线，并对曲线进行快速傅里叶变换；确定求解数值的计算方法，设置计算时间步长；运行模拟计算，以文本和图像的方式输出管道的振动频率变化曲线和管道周围的流场信息。该方法可以同时计算出管道周围的流场分布及管道的振动频率，有效避免管道产生涡激共振，提高了海底管道的安全性。