本发明提供了一种燃料电池电堆装置，属于燃料电池技术领域，解决了现有燃料电池电堆容易出现水淹且隔热不明显的问题。该装置包括前塑料端板、正极集流板、燃料电池组、负极集流板和后塑料端板、交流阻抗测量设备和控制器。其中，前塑料端板、正极集流板依次置于燃料电池组的正极侧，负极集流板、后塑料端板依次置于燃料电池组的负极侧。控制器，用于根据每一单片燃料电池的交流阻抗实时判断燃料电池是否发生水淹现象；以及，如果发生，进一步根据所述交流阻抗结合燃料电池电堆装置的输出电流调整进入燃料电池组的气体流量、气体湿度、尾排气排放周期，直到不发生水淹现象为止。实现了防水淹功能，且具有轻量化、加工成本低的效果。