本发明涉及水果鉴别技术领域，具体公开了一种基于信息融合技术的苹果鉴别系统，所述系统具体包括样本剔除模块，用于获取各苹果的光谱数据和理化值数据，并剔除异常样本；预处理模块，用于对所述光谱数据进行预处理，得到预处理后的数据；根据所述理化值数据对预处理后的数据进行特征波段筛选，得到筛选后的数据；模型建立模块，用于基于原始光谱数据、预处理光谱数据以及筛选后的光谱数据分别建立品种分类模型、产地识别模型；融合模块，用于融合所述品种分类模型和产地识别模型，得到苹果身份融合模型。本发明融合品种鉴别、产地鉴别模型对苹果进行身份识别，识别准确度极高，在原有的化学手段上增加了物理手段，便于推广。