本申请涉及水环境质量监测评价领域，尤其涉及一种地表水环境质量监测评价方法及系统，包括：依据所述监测点位所归属的地表水环境质量监测网络，确定地表水环境质量监测评价类型；依据地表水环境质量监测评价类型，确定地表水环境质量监测评价方法，并且依据地表水环境质量监测评价方法对监测数据进行分析评价，得到水质定性评价结果。由于本申请的地表水环境质量监测评价方法基系统可以对河流、水系、流域、湖泊、水库、区域和国家的地表水环境质量均进行监测评价，从而客观、真实地反映全国地表水环境质量状况和变化趋势，有利于地表水环境质量评价、考核和排名工作的深入推进。