本发明公开了一种双组份透水充填材料及其制备方法与应用，包括A组分和B组分，其中，A组分由以下重量份的组分组成：轻质陶粒50‑70份，水泥10‑30份，增稠剂0.1‑1份，纳米二氧化硅4‑6份，减水剂1‑2份，水8‑15份；B组分由以下重量份的组分组成：水玻璃60‑80份，磷酸氢二钠10‑20份，聚丙烯酰胺0.5‑2份，水10‑20份；使用时，将A组分和B组分按设定比例混合。该透水充填材料既能够实现泉域过水溶洞的的有效充填，又能保证城市地下水的有效运移，从而达到保护地下径流的目的。