本发明提供了一种树脂搅拌吸附制备高质量玻璃酸酶粗品的方法。提取过程采用氢离子化滤膜，通过弱酸型改性溶液处理制备的滤膜呈弱酸性，符合玻璃酸酶的存在环境，不会因长时间过滤影响玻璃酸酶的活性，还有效的降低了细菌内毒素的含量。利用稳定性好、吸附效率高的阳离子交换树脂进行提取，制备的玻璃酸酶效价达500IU/mg以上，比活在800 IU/mg.pr以上，细菌内毒素低至0.103EU。与沉淀提取法相比，用树脂吸附工艺大大提高了玻璃酸酶粗品的效价，为后序制备更高纯度的产品提供了高质量的原料，此外，利用本发明的杂质吸附剂进一步保障了玻璃酸酶的效价与使用安全性。