本发明提供了一种由恶性疟原虫RIFIN基因PF3D7_0833400编码的恶性疟原虫RIFIN重组蛋白，其基因序列如SEQ ID NO.1所示，氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。本发明还提供了一种含有基因PF3D7_0833400的重组质粒和含有蛋白PfRIFIN‑55的蛋白芯片。还公开了该种恶性疟原虫RIFIN重组蛋白的制备方法。与对照PfMSP1‑42相比，本发明的蛋白不仅具有较好的可特异性识别感染恶性疟原虫病人血清的能力，且对被恶性疟原虫感染的重症和非重症患者血清免疫反应表现出明显的差异，对重症患者血清的免疫反应阳性率明显低于对非重症患者血清免疫反应的阳性率。