本发明公开了一种深海环境用的桩锚基础结构及其安装方法，该桩锚基础结构包括：一桩锚本体；若干层间隔安装在桩锚本体上的锁定组件；一安装在桩锚本体上的基盘组件，基盘组件包括一下基盘以及设置在下基盘上的上基盘，下基盘上开有若干第一通孔，每个第一通孔的顶部开有一半径大于第一通孔半径的沉孔；上基盘上开有若干第二通孔，每个第二通孔的侧面设有若干环形滑槽，上基盘的顶面上安装有一锚固点；以及若干锁定装置，若干锁定装置一一对应地安装在上基盘的若干第二通孔内。本发明能够适用于水深大于100m的深海环境下桩锚本体与基盘组件之间的安装与锁定。