本发明公开了一种不停用保护的旁路断路器代替变压器断路器运行保护方法，应用于输配电网络220kV变电站双母线接线线路，解决现有技术在旁路断路器代替变压器断路器操作过程中不但失去差动保护，而且可能失去220kV后备保护的技术问题。本发明采用了220kV变电站220kV变压器保护比常规配置多1个电流支路配置方案或多2个电流支路配置方案，实现了在旁路断路器代替变压器断路器操作运行时，不需要停用变压器差动保护和该侧后备保护，防止操作过程中设备发生故障，变压器保护有完整的差动保护和后备保护，尤其是变压器差动保护能够快速切除故障线路，有利于电网安全稳定运行，提高了电网供电可靠性。