本发明公开一种沉水植物净化水质的室内试验工艺，其特征在于，具体包括以下步骤：底泥制备：取待修复水生态环境中的原状土，杀菌处理，得到底泥；试验污水制备：直接采用待修复水生态环境中污水或通过稀释生活污水模拟，得到试验污水；培植箱处理：以塑料箱为培植箱，在培植箱内，打入底泥，倒入试验污水，得到若干的培植箱体；沉水植物种植：单一沉水植物种植按照种植密度设定进行变化，每个箱体内，对应一种种植密度；组合沉水植物种植按照正交试验方法，制定种植方案；定期抽取每个培植箱体内水样，进行水质监测。提高沉水植物水质净化室内试验的科学性和可靠性。根据试验结果定量化评估三种沉水植物的水质净化效果及最佳的种植密度数据。