本发明公开了一种氟硼二吡咯类蛋白质错误折叠探针Halo‑BODIPY及其制备方法与应用，该荧光探针其结构式如下式Ⅰ所示。本发明的小分子荧光探针是利用Halo linker和氟硼二吡咯，通过有机合成反应制备得到，能够实现对错误折叠和聚集的蛋白质的有效识别，由于探针Halo‑BODIPY是基于氟硼二吡咯的发光母核设计而成，因此具有较低的细胞毒性，较好的生物相容性，稳定的荧光性质；摩尔吸收系数较大，抗背景干扰能力强，荧光量子产率高，可作为优异的探针设计平台，在生物成像、荧光标记、生物传感器、药物研发等领域有着极为重要的应用。