本发明公开了一种应用于电源转换器的一次侧的初级控制器及其操作方法。所述初级控制器包含一电流补偿电路和一补偿电压产生电路。所述电流补偿电路是用以根据一直流电压和一辅助电压，产生一补偿电流至所述一次侧的传感电阻，其中所述辅助电压和所述电源转换器的二次侧的输出电压有关，且所述补偿电流会改变所述一次侧的峰值电压。所述补偿电压产生电路是用以根据一参考电流、所述二次侧的放电时间和一峰值电流，产生一补偿电压，其中所述参考电流会随所述输出电压改变。所述补偿电流和所述参考电流是用以使所述电源转换器的二次侧的输出电流不随所述输出电压改变。因此，相较于现有技术，本发明可有效消除所述输出电压对所述输出电流的影响。