本发明提供了便于搜索安全性高的科研文档管理系统，所述系统包括注册模块、数据库、搜索模块和安全模块，注册模块用于记录保存所有用户的个人信息，包括姓名、数字ID和权限等级，所述数据库用于记录保存所有科研文档信息，所述搜索模块用于保存所述科研文档的搜索信息并利用所述搜索信息进行搜索，所述搜索信息包括作者数字ID、保密等级、内容类别、上传时间等，所述安全模块用于确保某一权限等级的用户只能查到对应的保密等级的科研文档。该系统通过严格的用户及文档的等级体系防止机密文件被泄露，又通过将科研文档的关键信息提取出作为搜索信息方便用户搜索到需要的科研文档。