本发明公开了一种复杂模拟电路故障识别与估计方法及系统，属于电力电子电路故障预测领域，其中，方法的实现包括：建立待诊断模拟电路的退化仿真模型，进行不同器件的参数老化模拟实验；利用时序变换方法提取输出信号的一系列时域特征，基于角相似度建立器件的健康指数；结合时间滑窗和卷积神经网络对电路是否发生退化及退化起点进行识别；复用前续识别网络中的部分隐含层和长短时记忆循环网络对退化中的模拟电路进行健康状态估计；对预测准确性进行评估。本发明能在准确识别模拟电路的故障状态起点的同时有效估计模拟电路的健康状态，具有运算效率高，识别准确的特点。