本发明公开了一种基于可配置端点重启的FPGA综合快速迭代方法及系统，方法包括：S100、将待检查项存入关键字库中，同时在整个FPGA综合的实现过程中设置多个断点；S200、基于关键字库中的待检查项，对FPGA综合的日志文件进行自动搜索，得到自动结果；S300、检查自动结果，若确定自动结果出现错误，则根据需要修改的内容确定开始重启FPGA综合的断点；S400、从确定的断点处重启FPGA综合，进行快速迭代。本发明基于可扩展的关键字库的自动结果检查，能够快速判断FPGA综合结果正确性，提高检查效率；通过配置断点重启可以实现FPGA综合快速迭代，避免不必要的重复运行步骤。