本发明提供一种富营养化水体的生物修复技术，属于生境修复领域，包括按照11‑13mg/L海水的比例投加姜油酮，按照3‑4.8g/L海水的比例投加预先培养8‑10d且生长良好的龙须菜，按照300‑500g/L海水的比例投加固定化复合菌，龙须菜投加2‑3d后，按照70‑120g/L海水的比例投加调节剂。本发明提供的方法能够刺激龙须菜碳酸酐酶基因的表达，提高碳酸酐酶的活性，提高光合作用效率，增强与赤潮藻竞争营养盐的能力，同时提高对赤潮藻的化感作用，能够有效改善水质。