本发明公开了一种时钟系统(100)，时钟系统(100)包括参考时钟模块(110)、锁相环模块(120)、锁相环电源模块(130)、锁相环故障监测模块(140)和锁相环故障处理模块(150)。参考时钟模块(110)用于输出参考时钟信号。锁相环模块(120)用于根据参考时钟信号输出处理时钟信号。锁相环电源模块(130)用于为锁相环模块(120)供电。锁相环故障监测模块(140)用于根据锁相环电源模块(130)的供电电压和处理时钟信号确定锁相环模块(120)的工作状态。锁相环故障处理模块(150)用于根据锁相环模块(120)的工作状态控制锁相环模块(120)和/或锁相环电源模块(130)及确定输出时钟信号。本发明还公开了一种处理方法和一种电子装置。