本发明涉及一种海洋来源的胶原蛋白膨胀蛋白酶VP9及其编码基因与应用。一株海洋弧菌Vibrio pomeroyi strain 12613，该菌株2020年3月6日保藏于中国典型培养物保藏中心，地址:中国，武汉，武汉大学，其菌种保藏编号为CCTCC NO:2020050。一种胶原蛋白膨胀蛋白酶VP9的编码基因，核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；上述编码基因表达的胶原蛋白膨胀蛋白酶VP9，氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明中的胶原蛋白膨胀蛋白酶VP9对胶原蛋白有显著的膨胀功能，但对胶原蛋白无降解活性，在皮革加工业以及其它领域胶原蛋白的膨胀处理中有很大的应用潜力。